Причинами побічних ефектів є: використання для мезотерапії лікарських засобів, не призначених для внутрішньошкірного введення; комбінація в одному шприці препаратів, не сумісних з біохімічним властивостям, при складанні «коктейлів»; використання лікарських засобів без попередніх аллергопроб; незнання мезотерапевтіческіх технік введення; недотримання правил асептики і антисептики.
На багатьох етикетках сучасних косметичних продуктів зараз можна бачити напис «повністю натуральний» (або «all natural» у разі зарубіжної косметики). Така маркування незмінно привертає симпатії споживача до косметичного засобу - адже у свідомості більшості людей «натуральний» означає «безпечний» і «корисний» (що дуже дивно, враховуючи, наскільки багато рослин в природі отруйні і наскільки багато живі істоти є небезпечними для людини).
Використання біологічно активних речовин у складі препаратів для зовнішнього застосування часто не приносить бажаного результату, тому що складно забезпечити проникнення активного компоненту через шкірний бар'єр. У 50-ті роки минулого століття Мішель Пістор ввів у лікарську практику новий метод лікування - метод мезотерапії, який у подальшому знайшов саме широке застосування.
Альтернативою класичної мезотерапії є електропорація, що здійснюється модульований Внутріволновой радіо частот (Е.М.В.Р.Ч. = Electoporation by Interwaved Modulated Radio Frequency (IMRF)).
Для безголкові мезотерапії найчастіше використовують апарати для електрофорезу і ультрафонофореза, рідше - для Лазерофорез, віброфореза, магнітофореза та ін Для доставки в дерму водорозчинних коштів переважно використовують електрофорез (синонім - іонофорез, естетичний електрофорез). Дана мезотерапевтіческая технологія дозволяє надати поєднане вплив на організм постійного електричного струму і вводиться з його допомогою в шкіру іонізованого лікарського або лікувально-косметичного засобу.